Video
(2002) Dibattito sul Gesù storico, Rai3 (con mons. Gianfranco Ravasi e Vittorio Messori)
(2003) Padre Pio: due voci a confronto, Rai Storia (con Andrea Tornielli)
(2007) Perché non possiamo essere cristiani, Rai3 (con Corrado Augias)
(2007) Perché non possiamo essere cristiani, La7
(2007) Opinioni e fatti sul processo a Galileo, BergamoScienza (con mons. Marcelo Sanchez Sorondo)
(2008) Fuori il papa dall’università, Rai1 (con mons. Rino Fisichella e Marco Pannella)
(2008) Processo a Gesù, La tenda di Ulisse di Catania (con Giuseppe Savagnone)
(2010) Uno scherzo da preti agli Italiani. Il concordato di Mussolini, Togliatti e Craxi, Giornate della Laicità di Reggio Emilia
(2011) Caro papa, ti scrivo, Giornate della Laicità di Reggio Emilia
(2011) Caro papa, ti scrivo, Teatro Parenti di Milano (con Moni Ovadia)
(2011) Caro papa, ti scrivo I e II, Incontro con i blogger a Milano
(2011) Perché non credo, Canale5
(2011) Dialogo sul buddhismo, Casa della Cultura di Milano (con Franco Bertossa)
(2013) Ragione e senso della vita, Repubblica delle Idee di Bari (con Vito Mancuso)
(2013) Il mio dialogo con Ratzinger, Repubblica.tv
(2013) Caro papa teologo, caro matematico ateo, QuartaRete
(2013) Una domanda al nuovo papa Francesco, Repubblica.tv
(2014) La vita I e II, Ordine dei Medici di Novara
(2015) Oltre l’uomo: Dio o no?, Festival delle Religioni di Firenze (con padre Giancarlo Bruni)
(2015) Canti di Natale negati a scuola, Rete4
(2016) La (in)compatibilità tra evoluzionismo e fede, Proversi
(2016) Videointervista su divulgazione e religione, Secondo Weekend Uaar Giovani di Milano
(2017) Io e Dio, Festival delle Religioni di Firenze (con padre Bernardo Gianni)
(2018) Scienza e religione, Università Federale di Recife
(2018) L’uomo e il cosmo tra scienza e fede, Cortile di Francesco ad Assisi (con mons. Vincenzo Paglia)
(2019) Il Concordato: uno scherzo da preti, Parlare Futuro di Montecorsaro
(2019) Cose dell’altro mondo, Salone del Libro di Torino (con Mauro Biglino)
(2019) Dialogo sull’infinito, Solidaria di Padova (con Vito Mancuso)
(2020) Scienza e religione di fronte al virus, Festival di Scienza e Filosofia di Foligno (con padre Enzo Fortunato)
Audio
(2005) Evoluzionismo o creazionismo I e II, Radio2 (con Moni Ovadia)
(2008) Il Cammino di Santiago, Radio3 (33 puntate, con Sergio Valzania e Franco Cardini)
(2012) Intervista sulla religione
Interventi
(2000) La Sindone, un mistero per modo di dire, Repubblica
(2006) Dialogo su “Cosa crede chi crede?”, Rescogitans (con Maurizio Ferraris)
(2006) La matematica non è un’opinione, la fede sì, Panorama
(2007) Lettera di solidarietà al cardinal Angelo Bagnasco, Repubblica
(2007) Pedofilia e pretofilia, La Stampa
(2007) Riflessioni sul senso della vita, Riflessioni
(2007) Il Pd, la laicità e la vergogna, Repubblica
(2008) Il Pd e la laicità, Repubblica
(2008) Lettera a Walter Veltroni sulla laicità, La Stampa
(2008) Un decalogo laico, La Rinascita della Sinistra
(2008) Si leyeran bien la Biblia, dejarían de creer, El Pais
(2010) Dialogo sulla Sindone, Micromega (con don Giuseppe Ghiberti)
(2010) Volevo fare il papa e sogno Porta Pia, Il Fatto Quotidiano (con Claudio Sabelli Fioretti)
(2011) Lo scherzo da preti del Concordato, Repubblica.it
(2011) Lettera al cardinal Gianfranco Ravasi, L’Espresso
(2011) Lettera all’onorevole Sandro Bondi, Panorama
(2012) Gerusalemme rivelata, L’Espresso
(2013) La matematica ci prova: “Ecco perché Dio esiste”, Repubblica
(2013) Intervista sulla lettera di Benedetto XVI, Uaar
(2016) La religione che ci rende stupidi, Left
(2018) Vita mea sub specie religionis, Micromega
(2020) Odifreddi: Cristo non esiste, e nemmeno la libertà, Pepeonline
(2020) Voleva diventare Papa, e ha scritto un libro con Ratzinger, La Stampa
(2020) Laicità ieri, oggi e domani, Blog UAAR (con Roberto Grendene)
(2021) Il lungo declino dei monoteismi, Left